Вопрос:
Не нахожу в своих настройках магазина установку MD5 (нет такой «галочки»). Соответственно не могу разрешить покупателю самому устанавливать сумму платежа.

Ответ:
Чекбокс MD5 находится в разделе «настройки по умолчанию».